A Santa Casa da Misericórdia de Évora foi instituída em Dezembro de 1499 e a sua primitiva sede localizou-se na Capela de S. Joãozinho, na Igreja de S. Francisco.

A actual igreja foi fundada em meados do século XVI. A sua construção é de estilo maneirista, portal rococó, decorado pelas armas reais de Portugal (1775). A nave, de planta rectangular, tem recheio sumptuário e ornamental de estilo barroco e as paredes estão forradas de azulejos historiados de A. Oliveira Bernardes e sobrepostos, painéis de pintura de José Xavier de Castro. Tem um imponente retábulo na capela-mor, de talha polícroma e colunata salomónica, de estilo barroco.